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Published: 2015年1月06日

The genome landscape of the African green monkey kidney-derived Vero cell line.

Osada N, Kohara A, Yamaji T, Hirayama N, Kasai F, Sekizuka T, Kuroda M, and Hanada K.

DNA Research, 21, 673-683, 2014

アフリカミドリザルの摘出腎臓から約半世紀前に日本国内で樹立された培養細胞株であるVero細胞は、多様なウイルスの増殖性がよく、さまざまな細菌毒素の感受性にも優れていることから、世界中で微生物学の研究だけでなく、病院での病原体検査や医薬品メーカによるウイルスワクチン生産にも汎用されてきました。

続きを読む: アフリカミドリザル腎由来Vero細胞のゲノム構造決定

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Published: 2014年12月22日

Development of an Efficient Entire-Capsid-Coding-Region Amplification Method for Direct Detection of Poliovirus from Stool Extracts.

Arita M, Kilpatrick DR, Nakamura T, Burns CC, Bukbuk D, Oderinde SB, Oberste MS, Kew OM, Pallansch MA, Shimizu H

Journal of Clinical Microbiology, 53: 73-78, 2015

ポリオ根絶計画が1988年に開始されて以来、ポリオ患者の確定診断のために、便抽出液から培養細胞を用いたポリオウイルス（PV）の分離・同定が行われている。しかし、判定に時間がかかるため、培養細胞を使わない検出法の開発が推奨されている。今回、50コピー以下のウイルスゲノムから、PVのカプシドタンパクコーディング領域全体（3.9 k nt）を増幅する新規法を開発した（ECRA法）。ECRA法と磁気ビーズPV濃縮法、リアルタイムPCRおよびVP1領域遺伝子解析を組み合わせることで、培養細胞を用いた場合と同程度の効率でPVを検出出来ることが示された。

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Published: 2014年8月05日

Phylogynamic Analysis Reveals CRF01_AE Dissemination between Japan and Nighboring Asian Countries and the Role of Intravenous Drug Use in Transmission.

Shiino, T., Hattori, J., Yokomaku, Y., Iwatani, Y., Sugiura, W. and Japanese Drug Resistance HIV-1 Surveillance Network.

PLoS One 9(7): e102633. doi:10.1371/journal.pone0102633

東南アジア諸国で流行しているHIV-1サブタイプの一つであるCRF01_AEは、我が国における疫学があまりわかっていない。我々は、日本薬剤耐性HIV-1サーベイランスネットワークに登録された3618名の患者のウイルス遺伝子配列を3種類の方法によって系統樹解析した。

続きを読む: 動的系統樹解析が明らかにしたHIV-1 CRF01_AEの我が国と隣接するアジア諸国との流行の関係と薬物利用者の役割