新型コロナウイルス感染症(COVID-19) 関連情報ページ
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国立感染症研究所
2021年4月5日時点
１．背景
従来株に比べて感染・伝播性や獲得免疫の効果に影響があるとされる新型コロナウイルス（SARS-CoV-2）の新規変異株が相次いで報告され、国際的な流行が懸念されている。これらの新規変異株はいずれも感染・伝播性に影響があるとされるN501Y変異を有する。2020年11月に英国南東部地域でSARS-CoV-2の新規変異株VOC-202012/01(lineage B.1.1.7)が報告されて以降、同株症例は同国内で急速に増加し、その後世界的に感染拡大を起こした。VOC-202012/01は従来株に比較して実効再生産数が43-90％高く[1,2]、また死亡リスクを55％上昇させるという報告がある[3]。しかし新規変異株症例の疫学的特性についてはまだ十分に解明されているとは言えない。英国ではVOC-202012/01が報告された当初に従来株に比べて小児の感染リスクが高い可能性が指摘され[4]、その後、英国公衆衛生庁の解析ではどの年代でもおしなべて2次感染率が上昇していることが報告された[5]。また南アフリカから最初に報告された501Y.V2株、日本においてブラジル渡航者から検出された501Y.V3株は、N501Y変異に加えて免疫逃避との関連が指摘されているE484K変異を有しており、ワクチンの効果が減弱する可能性が指摘されている。
日本では2020年12月25日に空港検疫で英国からの帰国者からVOC-202012/01が初めて検出された。さらに同年12月28日に南アフリカ共和国からの帰国者から501Y.V2が、2021年1月6日にブラジルから到着した渡航者4名から501Y.V3が検出された。その後、国内では主にVOC-202012/01症例のクラスターが確認されており、新規症例数が増加しつつある[6]。今後、新規変異株の流行拡大が想定されるなかで、その疫学的特性を明らかにすることは制御戦略を設計するうえで重要である。
本報告の目的は2021年4月5日までに日本国内で確認された新規変異株症例の特性を記述し、特に新規変異株症例の主体であるVOC-202012/01症例の感染・伝播性と感染リスクについて評価することである。
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掲載日：2021年4月5日
第28回新型コロナウイルス感染症対策アドバイザリーボード（令和3年3月31日、厚生労働省）の報告による、我が国における新型コロナウイルス感染症の状況等についてお知らせいたします（第28回新型コロナウイルス感染症対策アドバイザリーボード 資料2）。
直近の感染状況等
全国の新規感染者数は、報告日ベースでは、３月上旬以降増加が続いており、直近の１週間では10万人あたり約10人となっており、改めて減少傾向としていくことが必要。
- 実効再生産数：
- 全国的には、１月上旬以降１を下回っていたが、２月下旬以降１を超えており、直近（3/14時点）で1.06となっている。同時点で１都３県、愛知・岐阜、福岡では１を下回っているが、大阪・兵庫・京都では１を上回る水準となっている。
英国、南アフリカ等で確認されその影響が懸念されるN501Yの変異のある変異株（VOC）は、現状より急速に拡大するリスクが高い。自治体による積極的疫学調査が行われる中で、変異株の感染者の増加傾向が続き、クラスターの発生も継続。
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注目すべき感染症 ※PDF版よりピックアップして掲載しています。
◆直近の新型コロナウイルス感染症およびインフルエンザの状況（2021年3月26日現在）
新型コロナウイルス感染症：
2019年12月、中華人民共和国湖北省武漢市において確認され、2020年1月30日、世界保健機関（WHO）により「国際的に懸念される公衆衛生上の緊急事態（PHEIC）」を宣言され、3月11日にはパンデミック（世界的な大流行）の状態にあると表明された新型コロナウイルス感染症（COVID-19）は、2021年3月26日15時現在、感染者数（死亡者数）は、世界で125,492,070例（2,755,221例）、194カ国・地域（集計方法変更：海外領土を本国分に計上）に広がった（https://www.mhlw.go.jp/stf/newpage_17682.html）。
続きを読む: IDWR 2021年第11号＜注目すべき感染症＞ 直近の新型コロナウイルス感染症およびインフルエンザの状況
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新型コロナウイルスVOC-202012/01感染者の陰性確認完了までに要した日数とCt値の推移に関する考察
(速報掲載日 2021/4/2) (IASR Vol. 42 p101-102: 2021年5月号)新型コロナウイルス感染症（COVID-19）感染者の退院基準については、令和2（2020）年5月29日付事務連絡1）が通達されるまでは、症状消失後2回連続の核酸増幅法による陰性の確認が必要であったが、上記の事務連絡以後は発症日からの日数経過による退院および療養解除が認められている2）。一方で、英国や南アフリカ、ブラジル等で流行している、Spikeタンパク質のN501Y変異を持つ、「懸念される変異株（variants of concern: VOC）」については、令和2年12月25日付事務連絡において通常とは異なる退院基準が設定され、2回連続の核酸増幅法による陰性確認が必要となった3）。この陰性確認の要件を満たすためには、現在の通常のCOVID-19患者の療養解除基準である発症日から10日という日数を超えるケースが多く、入院病床の圧迫の一因となっている。本稿では神戸市においてPCR検査により2回の陰性が確認された90名のVOC-202012/01（英国型変異株）感染患者について、発症日から陰性確認完了に要した日数とCt値の推移を解析したものを報告する。なお、すべての検査は唾液検体からRNAを抽出し、病原体検出マニュアルに収載されているN2領域をターゲットとしたリアルタイムPCR法で実施した。機器はABI StepOne Plusを使用し、Ct値はThresholdを0.2に設定して算出した。
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国立感染症研究所では分離されたSARS-CoV-2英国変異株(VOC-202012/01)およびブラジル変異株（501Y.V3, P.1）に加えて、南アフリカ変異株(B.1.351)を試験研究に利用する研究機関等へ分与することといたしました。
分与は、感染研病原体等安全管理規程による「病原体等の分与等に関する取扱要領」に書かれた手続きに 従って行います(https://www.niid.go.jp/niid/ja/lab/481-biosafe/7155-bunyo-shogai17.html)。
注）本ウイルスは四種病原体です。本ウイルスの取扱いについてはBSL3/ABSL3施設が必要となります。
【病原体分与手続きについて】
下記病原体の分与担当研究者にメールもしくはお電話にてお問い合わせください。
【病原体の分与担当研究者】
ウイルス第一部第三室 伊藤睦代
電話：03-5285-1111（内線2531）
メール：This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.
【事務担当】
総務部調整課研究支援係
電話：03-5285-1111（内線2040,2052）
メール：This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.
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注目すべき感染症 ※PDF版よりピックアップして掲載しています。
◆直近の新型コロナウイルス感染症およびインフルエンザの状況（2021年3月12日現在）
新型コロナウイルス感染症：
2019年12月、中華人民共和国湖北省武漢市において確認され、2020年1月30日、世界保健機関（WHO）により「国際的に懸念される公衆衛生上の緊急事態（PHEIC）」を宣言され、3月11日にはパンデミック（世界的な大流行）の状態にあると表明された新型コロナウイルス感染症（COVID-19）は、2021年3月12日15時現在、感染者数（死亡者数）は、世界で118,570,917例（2,629,522例）、194カ国・地域（集計方法変更：海外領土を本国分に計上）に広がった（https://www.mhlw.go.jp/stf/newpage_17356.html）。
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2019-nCoV (新型コロナウイルス)感染を疑う患者の検体採取・輸送マニュアル(2021年3月19日更新版)
2019-nCoV（新型コロナウイルス）感染を疑う患者の臨床検体輸送の依頼が可能な運送会社については下記をご覧ください。
臨床検体輸送の依頼が可能な運送会社(令和3年2月10日現在)
更新履歴
| 2020年7月17日 | 臨床検体輸送の依頼が可能な運送会社(令和2年7月17日現在) |
| 2020年6月4日 | 臨床検体輸送の依頼が可能な運送会社(令和2年6月4日現在) |
| 2020年6月2日 | 2019-nCoV (新型コロナウイルス)感染を疑う患者の検体採取・輸送マニュアル(2020年6月2日更新) |
| 2020年4月16日 | 2019-nCoV (新型コロナウイルス)感染を疑う患者の検体採取・輸送マニュアル(2020年4月16日更新) |
| 2020年3月31日 | 2019-nCoV (新型コロナウイルス)感染を疑う患者の検体採取・輸送マニュアル(2020年3月31日更新) |
| 2020年3月16日 | 2019-nCoV (新型コロナウイルス)感染を疑う患者の検体採取・輸送マニュアル(2020年3月16日更新) |
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掲載日：2021年3月18日
第27回新型コロナウイルス感染症対策アドバイザリーボード（令和3年3月17日、厚生労働省）の報告による、我が国における新型コロナウイルス感染症の状況等についてお知らせいたします（第27回新型コロナウイルス感染症対策アドバイザリーボード 資料1）。
直近の感染状況等
全国の新規感染者数は、報告日ベースでは、１月中旬以降（発症日ベースでは、１月上旬以降）減少が継続していたが、３月上旬以降横ばいから微増が続き、直近の１週間では10万人あたり約６人となっており、リバウンドを起こさず、改めて減少傾向としていくことが必要。
- 実効再生産数：
- 全国的には、１月上旬以降１を下回っていたが、直近では、1.04となっている（２月28日時点）。１都３県、愛知・岐阜では１を下回っているが、大阪・兵庫・京都、福岡では１を上回る水準となっている。（２月28日時点）
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国立感染症研究所
2021年3月12日
- 国立感染症研究所は、2月25日にフィリピンから入国した者から501Y.V2株、501Y.V3株と同様にE484K, N501Yの変異を有するB.1.1.28系統株（系統名称未確定）を検出した（ウイルス名: hCoV-19/Japan/IC-0824/2021, GISAIDアクセスID: EPI_ISL_1198832) 。 •
- また、当該株には、VOC-202012/01株と同様にP681Hの変異が見られた。P681H変異は感染力に関与すると推定される。
- 以上のことから、これまでVOC（懸念される変異株）と総称してきたVOC-202012/01、501Y.V2株、501Y.V3株と同程度の脅威と考えられる。
- 本系統株は、フィリピンからGISAIDに34株が登録されている（1株は2/26、ほか33株は3/3に登録)(※)。 ※フィリピン保健省の発表(3/2)によると、E484K,N501Y変異をともに有する症例34例を報告しており、これが本系統株と想定される(1)。
- フィリピンでの本系統株のまん延状況は不明であり、最近のフィリピンにおける新規感染者の増加との関連が実証されたわけではない。WHO暫定定義におけるVOC（懸念される変異株）にはあてはまらないものの、フィリピン国内で当該株は検出され始めており、当地で一定程度まん延している可能性を踏まえ感染拡大の程度を注視する必要がある。
- 今後、フィリピンにおける感染拡大の状況を踏まえ、水際対策の強化を早急に検討するべきである。
- 変異株であっても、個人の基本的な感染予防策は、従来と同様に、3密の回避、マスクの着用、手洗いなどが推奨される。
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国立感染症研究所
掲載日：2021年3月9日
背景・目的
感染・伝播性の増加や抗原性の変化が懸念される新型コロナウイルス（SARS-CoV-2）の新規変異株の感染者が世界各地から報告され、いくつかの国ではこれらの変異株が感染者に占める割合が上昇傾向にある。国内においても、特に英国で最初に検出されたVOC-202012/01、南アフリカで最初に検出された501Y.V2、ブラジルからの帰国者において日本で最初に検出された501Y.V3の流行が懸念されており、これらを含む新規変異株の流行状況のモニタリングと特性の評価が求められる。本稿は、国内及び検疫で確認された新規変異株の状況を把握することを目的としている。
続きを読む: 日本における感染・伝播性の増加や抗原性の変化が懸念される 新型コロナウイルスの新規変異株症例について（2021年2月26日時点）