※PDF版をHTMLに変換して掲載しています。

●AIDS/HIV（後天性免疫不全症候群）（2013年第4号、第5号：2018年2月22日改訂）
●A型肝炎（2004年第14号）
●A群溶血性レンサ球菌咽頭炎（2003年第37号）
●Bウイルス病（2000年第41号、第42号）
●B型肝炎（2004年第15号：2013年6月19日改訂）
●C型肝炎（2004年第12号：2013年6月19日改訂）
●CCHS（クリミア・コンゴ出血熱）（2002年第31号）
●CJD（クロイツフェルト・ヤコブ病）（2002年第24号）
●CRS（先天性風疹症候群）（2002年第21号：2013年5月改訂）
●E型肝炎（2004年第13号）
●HTLV－1感染症（成人T細胞白血病）（2011年第7号）
●HIV/AIDS（後天性免疫不全症候群）（2013年第4号、第5号：2018年2月22日改訂）
●MERS（中東呼吸器症候群）（2014年6月9日更新）　
●MDRA（薬剤耐性アシネトバクター感染症）
●MDRP（多剤耐性緑膿菌感染症・薬剤耐性緑膿菌感染症）（2002年第17号） 
●MRSA（メシチリン耐性黄色ブドウ球菌感染症）（2002年第18号）
●NAGビブリオ感染症（2001年第12号） 
●PRSP （ペニシリン耐性肺炎球菌感染症）（2000年第32号）
●Ｑ熱（2002年第9号）
●RSウイルス感染症（2004年第22号）
●SARS（重症急性呼吸器症候群）（2005年第6号）
●SFTS （重症熱性血小板減少症候群）
●VRE（バンコマイシン耐性腸球菌感染症）（2002年第16号） 
●VRSA（バンコマイシン耐性黄色ブドウ球菌感染症）

■秋やみ（レプトスピラ症、ワイル病）（2003年第1・2合併号）
■アカントアメーバー感染症
■アシネトバクター感染症（MDRA・多剤耐性アシネトバクター・薬剤耐性アシネトバクター感染症）
■アデノウイルス感染症（咽頭結膜熱・プール熱）（2003年第14号）
■アニサキス症（2001年第5号：2014年5月13日改訂）
■アメーバ赤痢（2002年第30号）
■アライグマ回虫による幼虫移行症（2002年第42号）
■異形吸虫症
■イソスポラ感染症
■咽頭結膜熱（アデノウイルス感染症・プール熱）（2003年第14号:2014年4月1日改訂）
■インフルエンザ（2005年第8号）
■インフルエンザA(H7N9)
■インフルエンザ菌感染症
■ウイルス性出血熱
■ウエストナイル熱/ウエストナイル脳炎（西ナイルウイルス）（2002年第27号）
■ウエストナイル脳炎/ウエストナイル熱（西ナイルウイルス）（2002年第27号） 
■ウエルシュ菌感染症（2006年第33号）
■エキノコックス症（2001年第48号）
■エボラ出血熱（2002年第32号：2014年8月15日改訂）
■エルシニア感染症（2003年第4号）
■エロモナス・ハイドロフィラ／ソブリア感染症（2001年第3号）
■エンテロウイルス
■黄熱（2002年第23号）
■オウム病（2001年第45号）
■おたふくかぜ（流行性耳下腺炎、ムンプス）（2003年第35号）

●回帰熱（2002年第41号）
●疥癬（2011年第15号：2016年4月7日改訂）
●カルバペネム耐性腸内細菌科細菌感染症
●感染性胃腸炎（2003年第11号）
●広東住血線虫症（2004年第25号）
●カンピロバクター感染症（2005年第19号）
●急性ウイルス性肝炎（2002年第3号）
●急性灰白髄炎（ポリオ・小児麻痺）（2001年第26号）
●急性出血性結膜炎（2002年第33号）
●急性脳炎（日本脳炎を除く、また、ウエストナイル脳炎、西部ウマ脳炎、ダニ媒介脳炎、東部ウマ脳炎、日本脳炎、ベネズエラウマ脳炎及びリフトバレー熱を除く）（2003年第13号）
●狂犬病（2003年第18号）
●クラミジア肺炎（オウム病を除く）（2002年第7号）
●クリプトスポリジウム症（2005年第2号）
●クリミア・コンゴ出血熱(CCHF)（2002年第31号）
●クロイツフェルト・ヤコブ病（CJD）（2002年第24号）
●クロストリジウム・ディフィシル感染症 
●劇症型溶血性レンサ球菌感染症（2013年第8号：2013年2月8日改訂）
●結核（2003年第7号）
●下痢原性大腸菌感染症（2000年第50号）
●後天性免疫不全症候群（HIV/AIDS）（2013年第4号、第5号：2018年02月22日改訂）
●コクシジオイデス症（2003年第24号）
●コリネバクテリウム・ウルセランス感染症 
●コレラ（2000年第1号）

■細菌性髄膜炎（2003年第38号）
■細菌性赤痢（2002年第8号）
■サイクロスポラ感染症
■サイトメガロウイルス感染症（2003年第15号）
■サル痘（2006年第14号）　　
■サルモネラ感染症（2004年第5号）
■ジアルジア症（2004年第49号）
■ジカ熱（2016年1月22日）
■ジフテリア（2002年第14号）
■住血吸虫症（2006年第41号）
■重症急性呼吸器症候群（SARS）（2005年第6号）
■重症熱性血小板減少症候群（SFTS）
■小児麻痺（急性灰白髄液・ポリオ）（2001年第26号）
■シラミ症（2006年第26号） 
■真菌症
■腎症候性出血熱（2004年第51号：2013年6月14日改訂）
■水痘（水ぼうそう）（2001年第24号）
■水痘（入院例）
■髄膜炎菌性髄膜炎（2005年第20号）
■セアカコケグモ咬症（2013年2月1日）
■性器クラミジア感染症（2004年第8号）
■性器ヘルペスウイルス感染症（2002年第51号）
■成人T細胞白血病（HTLV-1感染症）（2002年第38号）
■セレウス菌感染症（2003年第5号）
■尖形コンジローマ（2002年第26号：2013年6月11日改訂）
■先天性風疹症候群（CRS）（2002年第21号：2013年5月改訂）
■旋尾線虫症（2001年第14号）
■旋毛虫症
■ソブリア感染症／エロモナス・ハイドロフィラ（2001年第3号）

●多剤耐性緑膿菌感染症（薬剤耐性緑膿菌感染症・MDRP）（2002年第17号）
●ダニ媒介性脳炎（2002年第4号: 2018年8月27日改訂）
●炭疽（2005年第12号: 2018年4月25日改訂）
●単純ヘルペスウイルス
●チクングニア熱（2007年第19号）
●中東呼吸器症候群（MERS） 
●腸炎ビブリオ感染症（2004年第10号）
●腸管出血性大腸菌感染症（2002年第6号）
●腸チフス（パラチフス）（2002年第5号：2018年2月19日改訂） 　
●ツツガムシ病（つつが虫病）（2002年第13号）
●手足口病（2001年第27号：2014年10月17日改訂）
●テニア症
●デング熱（デング出血熱）（2004年第50号：2014年10月14日改訂）
●デング出血熱（デング熱）（2004年第50号：2014年10月14日改訂） 
●伝染性紅斑（リンゴ病・ほっぺ病）（2004年第23号）
●伝染性単核症（2003年第23号）
●天然痘（痘そう）（2001年第40号）
●トキソカラ症
●トキソプラズマ症（2013年第3号：2012年12月13日改訂）
●毒素原生大腸菌感染症
●突発性発疹（2003年第28号）
●痘そう（天然痘）（2001年第40号）
●鳥インフルエンザ

■西ナイルウイルス（ウエストナイル熱/ウエストナイル脳炎）（2002年第27号）
■ニパウイルス感染症（2005年第3号）
■日本紅斑熱（2002年第25号）
■日本脳炎（2002年第1・2合併号）
■乳児ボツリヌス症（2001年第46号）→ボツリヌス症 （2017年5月19日改訂）
■ネグレリア感染症
■ノロウイルス感染症（2007年第9号）

●肺炎球菌感染症
●肺吸虫症
●梅毒（2001年第49号：2014年11月7日改訂）
●播種性クリプトコックス症
●破傷風（2002年第15号）
●パラチフス（腸チフス）（2002年第5号）
●バラムチア感染症
●バンコマイシン耐性黄色ブドウ球菌感染症（VRSA）
●バンコマイシン耐性腸球菌感染症（VRE）（2002年第16号） 
●ハンセン病（2011年第13号：2015年2月12日改訂;2016年4月7日改訂 ）
●ハンタウイルス肺症候群（2003年第25、26号）
●ヒストプラスマ症（2001年第1号）
●鼻疽（類鼻疽）
●ビブリオ・フルビアリス／ファーニシ感染症（2001年第9号）
●百日咳（2003年第36号：2018年1月29日改訂） 
●ファーニシ感染症／ビブリオ・フルビアリス（2001年第9号）
●プール熱（咽頭結膜熱・アデノウイルス感染症）（2003年第14号）
●風疹（2001年第29号：2013年5月7日改訂）
●ブタ連鎖球菌感染症
●ブドウ球菌食中毒（2001年第13号）
●ブルセラ症（2002年第10号:2019年10月16日改訂）
●ブルーリ潰瘍（2018年4月20日改訂）
●プレジオモナス・シゲロイデス感染症（2001年第2号）
●ペスト（2001年第51号:2019年12月27日改訂）
●ペニシリン耐性肺炎球菌感染症（PRSP）（2000年第32号）
●ヘルパンギーナ（2003年第8号：2014年7月23日改訂）
●ヘルペス脳炎（2003年第6号）
●発しんチフス（2005年第9号） 
●ほっぺ病（リンゴ病・伝染性紅斑）（2004年第23号） 
●ボツリヌス症（乳児ボツリヌス症を含む）（2017年5月19日改訂）

●ポリオ（急性灰白髄液・小児麻痺）（2001年第26号）

■マールブルグ病 （2002年第36号）
■マイコプラズマ肺炎（2003年第9号）
■麻疹（はしか）（2003年第3号: 2017年6月7日改訂）
■マラリア（2013年第10号：2013年3月7日改訂）
■ミクロスポリディア（微胞子虫）感染症
■水ぼうそう（水痘）（2001年第24号） 
■無菌性髄膜炎（2003年第12号）
■ムンプス（流行性耳下腺炎、おたふくかぜ）（2003年第35号） 
■メチシリン耐性黄色ブドウ球菌感染症(MRSA)（2002年第18・19合併号）

●薬剤耐性アシネトバクター感染症（MDRA）
●薬剤耐性緑膿菌感染症（多剤耐性緑膿菌感染症・MDRP）（2000年第36号、第37号）
●野兎病（2006年第22号）
●幼虫移行症（アライグマ回虫による幼虫移行症とは）（2002年第42号）

■ライム病（2002年第11号: 2019年3月20日改訂）　
■ラッサ熱（2002年第35号）
■リケッチア症
■リステリア・モノサイトゲネス感染症（2001年第4号）
■リッサウイルス感染症（2006年第20号）
■流行性角結膜炎（2002年第29号:2014年4月1日改訂）
■流行性耳下腺炎（ムンプス、おたふくかぜ）（2003年第35号）
■淋菌感染症（2002年第22号） 
■リンゴ病（ほっぺ病・伝染性紅斑）（2004年第23号）
■類鼻疽（鼻疽）
■裂頭条虫症
■レジオネラ症（2002年第12号：2014年6月25日改訂）
■レプトスピラ症（秋やみ、ワイル病）（2003年第1・2合併号）
■ロタウイルス感染症（2013年5月15日作成）