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国立感染症研究所インフルエンザウイルス研究センター第一室
全国地方衛生研究所 |
| 遺伝子系統樹 |
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| 2017/2018シーズン系統樹（データ更新日：2018年8月22日）NEW |
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A(H1N1)pdm09：解析した株は全てHA遺伝子系統樹上のクレード6B.1（共通アミノ酸置換：S84N, S162N, I216T）内のS74R, I295V群に属していた（図1）。またほとんどのウイルスはS74R, I295V群内に分岐したS164T群に属し、さらにP137S, I267T, I372L群、L161I, I404M群、S183P群、T120A群など複数の集団を形成した。NAタンパク質にH275Y置換を有するオセルタミビル耐性株は散発的に検出されているが、耐性株の流行は確認されていない。
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A(H3N2)：最近の流行株はHA遺伝子系統樹上のサブクレード3C.2a（L3I, N144S, F159Y, K160T, Q311H, D489N、代表株：A/Hong Kong/4801/2014）に属している（図2）。3C.2a内にはサブクレード3C.2a1（N171K, I406V, G484E、代表株：A/Singapore/INFIMH-16-0019/2016）、3C.2a2（T131K, R142K, R261Q）、3C.2a3（N121K, S144K）、3C.2a4（N31S, D53N, R142G, S144R, N171K, I192T, Q197H）が形成されている。2018年1月以降、3C.2a2株が増加傾向(76.7%)にある。3C.2a1はさらに、3C.2a1a（N121K, G479E, T135K, N122D）、3C.2a1b（N121K, K92R, H311Q）に分岐し、3C.2a1b内には3C.2a1b+135K（E62G, R142G, T135K; 18.6%）および3C.2a1b+135N（T135N; 4.7%）が、3C.2a2内にはA212T群が形成されており、遺伝子的に多様化が進んでいる。
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B (ビクトリア系統)：解析した株は全て、HA遺伝子系統樹上のクレード1A（共通アミノ酸置換N75L、N165K, S172P、代表株：B/Brisbane/60/2008、B/Texas/02/2013）内の、N129D, I117V, V146Iを有する集団に属していた（図3）。その中で複数の群が形成されており、遺伝子的には多様化が進んでいる。その中で、ワクチン株（B/Brisbane/60/2008あるいはB/Texas/02/2013）に対して抗原性変異株のサブクレード1A.1［共通アミノ酸置換I180V, R498Kおよび2アミノ酸欠損（162, 163）、代表株：A/Maryland/15/2016］に属するウイルスが2月以降増加傾向にあり、今後の流行が注目される。現在までに日本では、1A.1株は8株検出されている。
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B (山形系統)：解析株は全て、HA遺伝子系統樹上のクレード3（共通アミノ酸置換S150I, N165Y, N202S, S229D）内でB/Phuket/3073/2013株を代表とする群（共通アミノ酸置換N116K, K298E, E312K）内のL172Q, M251V群に属した（図4）。また、共通アミノ酸を持たない集団も多く形成されており、遺伝子的に多様化が進んでいる。
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