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2011/12シーズン最初の2011年第36週に大阪府で幼稚園での集団発生例からノロウイルスgenogroup(G)I/4が検出されている（速報参照：堺市）。第39週以降、散発例・集団発生例からノロウイルスGIIの報告が増加し、第50週をピークに一旦減少した。2012年第2～3週には再び増加したが、第4週以降減少している。一方、第4週以降、Ａ群ロタウイルスが徐々に増加している。
2011年第36週～2012年第19週にノロウイルスGIが22都府県から178件（うち、GI/4 48件 、GI/14 13件、GI/8 12件、GI/1 5件、GI/3 5件、GI/7 3件、GI/2 2件、GI/6 1件、GI/13 1件）、ノロウイルスGIIが45都道府県から1,846件（うち、GII/4 402件、GII/2 78件、GII/13 29件、GII/12 28件、GII/6 22件、GII/3 19件、GII/7 4件、GII/5 3件、GII/14 1件）、サポウイルスが28都府県から136件（うち、GI 51件、GII 8件、GIV 1件）報告されている。また、Ａ群ロタウイルスが28都府県から313件報告されており、うち遺伝子型G1 63件、G3 30件、G2 10件（速報参照：茨城県）、G9 9件であった。この他にＣ群ロタウイルスが新潟県から5件、アストロウイルスが7府県から14件（うち1型3件、4型1件）報告されている。
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