2013年に広域において見出された同一PFGEタイプを示す腸管出血性大腸菌O157およびO26について

国立感染症研究所細菌第一部に送付され、解析を行った2013年分離のヒト由来腸管出血性大腸菌(EHEC)は2,636株あり、そのうちO157は1,465株、O26は633株あった（2014年２月現在）。2013年にはXbaIによるパルスフィールド・ゲル電気泳動(PFGE)パターンがO157で768種類（2013年に初めて検出されたパターンはi1～i680）みられ、少なくとも３つ以上の異なる都府県から分離された同一PFGEパターンが41種類あった。このうち、６つ以上の都府県から分離されたO157には５種類の泳動パターンがあり〔Type No. (TN) d483、h406、g307、i28、i195〕、特にTN d483およびh406を示す株は、16府県、10都府県の広域で分離されていた（図１）。また、O26では、2013年にXbaIによるPFGEパターンが244種類（このうち2013年に初めて分離されたものはi1～i232）みられ、５つ以上の異なる都府県から分離された同一PFGEパターンが２種類 (TN i16、i110)あった。TN ｄ483は2008年に初めて分離された後、毎年６つ以上の都道府県から分離されているパターンであり、TN h406は2012年に初めて分離されたパターンである。それぞれのパターンを示す株は、５～６カ月にわたって各地の散発事例から分離されており、TN h406のパターンを示す株は集発事例からも分離されていた。

上記広域株のうち、TN d483を示す株を反復配列多型解析法（multiple-locus variable-number tandem repeat analysis; MLVA）で試験すると、いくつかのタイプが得られた。これらについてminimum spanning treeを描くと、４つの型は互いにsingle locus variants（SLVs）であり、これらの株については近縁性が示唆された。一方、残りの型はそれらと2遺伝子座以上の距離があり、d483を示す株には近縁性の低いMLVA型を示す菌株が含まれることが示された（図２）。

現在O157、O26、O111に関してはMLVAによるタイピングの整備を進めており、文献１）に示されている18遺伝子座のうち、O157-10を除く17遺伝子座のリピート数に基づいてMLVA型を付与している。参考までに　上記広域分離PFGE TNに対して、これまでわかっているMLVA型を次ページ表１に示す（いずれも2013年分離株の結果である）。上記d483の場合を除き、ほとんどの場合は、複数のMLVA型が出ていても互いにSLVの関係にある。

広域分離株の探知のためには、迅速な情報還元を可能とするMLVA法が有効であり、今後はその活用を進めていく必要がある。