国立感染症研究所

IASR-logo

2015年に分離された腸管出血性大腸菌O157, O26およびO111株のMLVA法による解析

(IASR Vol. 37 p. 93-95: 2016年5月号)

国立感染症研究所(感染研)細菌第一部では2014年シーズンから腸管出血性大腸菌O157, O26およびO111についてmultilocus variable-number tandem-repeat analysis(MLVA)法 による分子疫学解析の運用を開始している。本稿では2015年に発生した主要な集団事例関連株, 広域株等を中心にMLVA法による解析結果をまとめた。2016年3月30日までに感染研に送付された2015年分離株は2,591(同時期前年比4.9%減)であり, このうちO157は1,504(同6.5%減), O26は643(同19%増), O111は73(同38%減)であった。これらの株をMLVA法によって解析した結果同定された型の数は, O157が545(前年比11%減), O26が209(6.1%増), O111が45(7.1%増)であり, それぞれのSimpson’s Diversity Index*(SDI)は0.990, 0.932, 0.979であった(*多様性を表す指数の1つ。0-1の範囲で1に近いほど多様性が高く, 0に近いほど多様性が低いことを示す)。O26のSDIが低いのは後述の集団事例株が多数あったことによる。表1に検出された菌株数が多かったMLVA型およびその各遺伝子座のリピート数を示す。

Copyright 1998 National Institute of Infectious Diseases, Japan

Top Desktop version