大腸菌の血清型別PCR法・続報（非定型O血清群の分類）

(IASR Vol. 42 p94-95: 2021年5月号)

非定型血清型とは

　2020年5月号のIASR「大腸菌の血清型別PCR法:https://www.niid.go.jp/niid/ja/typhi-m/iasr-reference/2519-related-articles/related-articles-483/9625-483r01.html」で解説したように, ほぼすべての定型血清型（O1からO188までのO血清群とH1からH56までのH型）は抗原コード遺伝子の塩基配列の違いによって識別することができ, それぞれを判定できるPCR法（E. coli Og-/Hg-typing PCR:https://www.niid.go.jp/niid/images/lab-manual/EHEC20190920.pdf）や, 全ゲノム配列を用いた相同性検索Webサイト（SerotypeFinder: https://cge.cbs.dtu.dk/services/SerotypeFinder/）が開発され, 調査や研究に利用されている。一方で, 完全タイピング用の抗血清セットや, 上述した抗原コード遺伝子を標的とした網羅的判定手法を用いても型別することができない（非定型血清型）大腸菌株が存在する。このような分離株は型別不能〔抗血清凝集試験ではO血清群UT（OUT）/H抗原UT（HUT）, 遺伝学的手法ではOgUT/HgUT〕な一群として扱われてきた。