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2017年に分離された腸管出血性大腸菌のMLVA法による解析

(IASR Vol. 39 p81-82: 2018年5月号)

国立感染症研究所(感染研)細菌第一部では2014年シーズンから腸管出血性大腸菌O157, O26およびO111についてmultilocus variable-number tandem-repeat analysis(MLVA)法による分子疫学サーベイランスを行っている。本稿では2017年に発生した主要な集団事例関連株, 広域株等を中心にMLVA法による解析結果をまとめた。2018年3月10日までに感染研に送付された2017年分離株は2,913(同時期前年比13%増)であり, このうちO157は1,619(同5.5%増), O26は696(同13%増), O111は128(同83%増)であった。これらの株をMLVA法によって解析した結果同定された型の数は, O157が597(前年比6.6%増), O26が250(同24%増), O111が54(同42%増)であった。それぞれのSimpson’s Diversity Index(SDI)は0.972(昨年0.990), 0.985(同0.985), 0.918(同0.969)であった。2017年は上記3血清群以外にO103, O121, O145, O165, O91について, プライマーを追加し解析した。それぞれの解析株数, 検出型数, SDIは, O103が144株, 46型, 0.909, O121が75株, 32型, 0.955, O145が43株, 19型, 0.859, O165が8株, 8型, 1, O91が41株, 33型, 0.988であった。表1に検出された菌株数が多かったMLVA型およびその各遺伝子座のリピート数を示す。

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