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地方衛生研究所（地衛研）では、感染症発生動向調査の定点医療機関およびその他の医療機関、保健所等で採取された検体から病原体検査を行っている。検出された病原体情報は、感染症サーベイランスシステム（NESID）・病原体検出情報の入力フォーム“病原体個票”や“集団発生病原体票”により報告されている。
ノロウイルスをはじめ、サポウイルス、ロタウイルス、アストロウイルスなどの胃腸炎ウイルスの検出には、散発例のほかに保育所、幼稚園、小学校、老人施設、福祉・養護施設などにおける「感染性胃腸炎」の集団発生や、飲食店、宿舎・寮などにおける「食中毒」や「有症苦情」からの検出が含まれている。
「感染性胃腸炎」から検出されている病原体は、ノロウイルスが最多である。検出されたノロウイルスでは、ノロウイルスgenogroup II（GII）が8割以上を占める（図１および図２）。検出されているノロウイルス遺伝子型別の内訳は図４・図５を参照。
※2015/16シーズンからノロウイルスの遺伝子型別法に変更があり、表記も変更された。（例：GII.17は旧表記ではGII/11）（詳しくはIASR記事ノーウォークウイルス（ノロウイルス）の遺伝子型（2015年改訂版）・比較表を参照。）
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