2019年に報告された腸管出血性大腸菌集団感染事例の全ゲノム配列解析

(IASR Vol. 41 p70-71: 2020年5月号)

現在, 腸管出血性大腸菌（EHEC）感染症の早期検知や原因の究明を目的としたサーベイランスでは, multilocus variable-number tandem repeat analysis（MLVA）やパルスフィールドゲル電気泳動（PFGE）法といった分子型別手法を用いた菌株間の比較が行われている。近年, 高速シークエンサーの実用化により, 集団感染等の調査に全ゲノム配列（whole-genome sequence:WGS）を用いた解析が確立されつつある。そこで, 2019年に発生した飲食店関連の集団感染由来株およびMLVA類似株のWGS解析を行った。