注目すべき感染症　※PDF版よりピックアップして掲載しています。

◆直近の新型コロナウイルス感染症およびインフルエンザの状況（2021年2月12日現在）

新型コロナウイルス感染症：

　2019年12月、中華人民共和国湖北省武漢市において確認され、2020年1月30日、世界保健機関（WHO）により「国際的に懸念される公衆衛生上の緊急事態（PHEIC）」を宣言され、3月11日にはパンデミック（世界的な大流行）の状態にあると表明された新型コロナウイルス感染症（COVID-19）は、2021年2月12日15時現在、感染者数（死亡者数）は、世界で107,778,070例（2,368,501例）、194カ国・地域（集計方法変更：海外領土を本国分に計上）に広がった（https://www.mhlw.go.jp/stf/newpage_16707.html）。

新型コロナウイルスSARS-CoV-2 Spikeタンパク質 E484K変異を有するB.1.1.316系統の国内流入（2021年2月2日現在）

新型コロナウイルス変異株が有するSpikeタンパク質E484K変異

　自治体の積極的疫学調査を支援すべく、SARS-CoV-2（一本鎖プラス鎖RNAウイルス、全長29.9 kb）のゲノム配列を確定してGISAID^*1へ配列登録し、感染クラスターに特有な遺伝子情報およびクラスター間の共通性を解析中である。これまでに4回にわたって中間報告として国内伝播の状況を概説してきた（2020年4月27日^1）、2020年8月6日^2）、2020年12月11日^3）、2021年1月14日^4））。2020年3～4月に欧州系統（Pangolin^*2系統B.1.1.114）の流入が認められたものの、第2、3波の主流はこの欧州系統から派生したB.1.1.284とB.1.1.214による国内の感染拡大であることが判明した（2021年1月14日報告^4））。さらに、英国で発生した新規変異株VOC-202012/01 の流入が懸念されており、空港検疫検査のみならず、市中感染の疑いを示す事例が公表されている。

2021年2月18日
国立感染症研究所感染症疫学センター

令和２年３月6日の結核感染症課事務連絡「『新型コロナウイルス（SARS-CoV-2）の陰性が確認され退院される患者の方々へ』の配布について」では、退院後の経過観察期間を４週間設け、再陽性化等に備えた症状の経過観察や感染管理などを求めていたが、現行の退院基準のうち、退院時に検査を実施しない場合の基準（発症日から10日間かつ症状軽快後72時間経過）との齟齬が生じているとの指摘もあり、発症からの感染可能期間についてのエビデンスや再陽性症例における感染性や二次感染リスクに関するエビデンスをまとめた。

なお、本文書においては、発症初日を発症0日目として、発症翌日を発症1日目と定義している。

　注目すべき感染症　※PDF版よりピックアップして掲載しています。

◆直近の新型コロナウイルス感染症およびインフルエンザの状況（2021年1月29日現在）

新型コロナウイルス感染症：

　2019年12月、中華人民共和国湖北省武漢市において確認され、2020年1月30日、世界保健機関（WHO）により「国際的に懸念される公衆衛生上の緊急事態（PHEIC）」を宣言され、3月11日にはパンデミック（世界的な大流行）の状態にあると表明された新型コロナウイルス感染症（COVID-19）は、2021年1月29日15時現在、感染者数（死亡者数）は、世界で101,452,470例（2,191,027例）、194カ国・地域（集計方法変更：海外領土を本国分に計上）に広がった（https://www.mhlw.go.jp/stf/newpage_16444.html）。

新型コロナウイルスSARS-CoV-2ゲノム情報による分子疫学調査（2021年1月14日現在）

新型コロナウイルス・ゲノム疫学解析によるクラスター対策

　2019年末の中国・武漢市で初めて確認された新型コロナウイルス（SARS-CoV-2）は、2020年１月に国内で初めて感染者が確認された。その後、現在まで地域的な感染クラスター（集団）とその集合体による複数回の感染ピークを生じている。自治体の積極的疫学調査を支援すべく、SARS-CoV-2（一本鎖プラス鎖RNAウイルス、全長29.9 kb）のゲノム配列を確定し、感染クラスターに特有な遺伝子情報およびクラスター間の共通性を解析している。これまでに３回にわたってゲノム情報が示す国内伝播の状況を概説してきた（2020年4月27日^1）、2020年8月6日^2）、2020年12月11日^3））。また、日本国内^4,5）、ダイヤモンド・プリセンス号の乗員乗客6）、空港検疫所の陽性検体^7）より確定されたSARS-CoV-2ゲノム配列の解析については学術誌にて参照可能である。

検体中のSARS-CoV-2ウイルスコピー数とウイルス力価に係る考察

(IASR Vol.42 p22-24: 2021年1月号)

はじめに

　仙台市における最初の新型コロナウイルス感染症（COVID-19）感染者は2020年2月29日に確認され, それ以降9月30日までに261名の新規患者が確認されている。そこで, 新型コロナウイルス（SARS-CoV-2）の遺伝子が検出された検体について, ウイルス分離を試み, ウイルスコピー数との相関性を考察した。

　注目すべき感染症　※PDF版よりピックアップして掲載しています。

◆直近の新型コロナウイルス感染症およびインフルエンザの状況（2021年1月8日現在）

新型コロナウイルス感染症：

　2019年12月、中華人民共和国湖北省武漢市において確認され、2020年1月30日、世界保健機関（WHO）により「国際的に懸念される公衆衛生上の緊急事態（PHEIC）」を宣言され、3月11日にはパンデミック（世界的な大流行）の状態にあると表明された新型コロナウイルス感染症（COVID-19）は、2021年1月8日15時現在、感染者数（死亡者数）は、世界で88,040,978例（1,898,713例）、193カ国・地域（集計方法変更：海外領土を本国分に計上）に広がった（https://www.mhlw.go.jp/stf/newpage_15947.html）。

 新型コロナウイルス感染症患者に対する積極的疫学調査実施要領（2021年1月8日暫定版）（1月14日再掲載*）

*1月8日に掲載したPDFファイルに誤りがありましたので、下記の通り訂正しました。

　P5　下から２行目

　（誤）積極的疫学調査を補助する手段
　　↓
　（正）積極的疫学調査を補完する手段

 調査票（案）（2021年1月8日更新）

 

 

【更新履歴】

2020年5月29日	新型コロナウイルス感染症患者に対する積極的疫学調査実施要領（2020年5月29日暫定版）  調査票（案）（2020年4月20日更新）
2020年4月27日	積極的疫学調査実施要領における濃厚接触者の定義変更等に関するQ&A
2020年4月20日	新型コロナウイルス感染症患者に対する積極的疫学調査実施要領（2020年4月20日暫定版）  調査票（案）（2020年4月20日更新）

続きを読む: 新型コロナウイルス感染症患者に対する積極的疫学調査実施要領（2021年1月8日版）