東京都内で検出された麻疹ウイルス遺伝子のM/F-NCR領域を用いた解析

(IASR Vol. 43 p205-206: 2022年9月号)

　わが国では麻疹排除状態の継続確認のために, 麻疹疑い患者の核酸増幅検査と検出された麻疹ウイルスの解析が全国の地方衛生研究所を中心に実施されている。これらの検査・解析は地域における積極的疫学調査としての追跡調査の意味合いも併せ持つ。通常, 疫学解析には発生届による推定感染地域などの情報に加え, 検出された麻疹ウイルス遺伝子の塩基配列が用いられる。ウイルス遺伝子の検出および解析には病原体検出マニュアル^1）記載の麻疹ウイルス遺伝子のreal-time RT-PCRと, N遺伝子型決定領域（N遺伝子領域）の塩基配列解析が広く利用されている。しかしながら, N遺伝子領域の検出感度は高いが, 複数の, 由来の異なる症例においても共通した塩基配列が検出されることが散見され, 疫学的な関連性を遺伝子解析からは証明できない場合がみられていた。そこで, 東京都で麻疹ウイルス遺伝子が検出された試料を用い, 近年報告されたnoncoding region between the matrix and fusion genes （M/F-NCR）領域を用いた塩基配列解析との比較を試みた。