研究にかかわる事業の企画と実施についての総合的な調整を行っている。

特に、国立感染症研究所内の研究プロジェクトの企画と実施についての総合的な調整、 関係行政機関との連絡・調整、他の研究機関との研究プロジェクトの調整を行っている。

第一室　（研究企画室）

国立感染症研究所の所掌事務に係る調査及び研究に関する重要事項の総括及び知財戦略等の技術的指導に関することの調整を行っている。

第二室　（研究調整室）

国立感染症研究所の所掌事務に係る調査及び研究に関する特定事項の総括及び所外組織の連携、共同研究の実施に関することの調整を行っている。