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2021年11月26日
国立感染症研究所
国立感染症研究所は、PANGO系統でB.1.1.529系統に分類される変異株を、感染・伝播性、抗原性の変化等を踏まえた評価に基づき、注目すべき変異株（VOI：Variants of Interest）として位置づけ、監視体制の強化を行う。
B.1.1.529系統について
- B.1.1.529系統は、スパイクタンパク質に32か所の変異を有している。それらの変異のうち、H655Y、N679K、P681HはS1/S2フリン開裂部位近傍の変異であり、細胞への侵入しやすさに関連する可能性がある。nsp6 における 105-107 欠失はアルファ株、ベータ株、ガンマ株、ラムダ株にも存在する 変異であり、免疫逃避に寄与する可能性や感染・伝播性を高める可能性がある。ヌクレオカプシドタ ンパク質における R203K、G204R 変異はアルファ株、ガンマ株、ラムダ株にも存在し、感染・伝播性 を高める可能性がある(1）。
- 2021年11月24日、WHOはB.1.1.529系統を監視下の変異株（Variant Under Monitoring; VUM）に分類した(2)。同年11月25日、欧州CDC（ECDC)は同系統を注目すべき変異株（Variant of Interest)に分類した(3)。
表 SARS-CoV-2 B.1.1.529系統の概要
|
PANGO 系統名
|
日本 感染研 |
WHO |
EU ECDC |
UK HSA |
スパイクタンパク質受容体結合ドメインの主な変異 |
検出報告国数 |
|
B.1.1.529 |
VOI |
VUM |
VOI |
International VUI |
K417N, N440K, G446S, S477N, T478K, E484A, Q493K, G496S, Q498R, N501Y, Y505H |
3 |
海外での流行状況と評価
- 2021年11月25日時点で南アフリカで77例(1)、ボツワナで4例(1)、香港で2例(4)が確認されている。
- 南アフリカにおいてはハウテン州においてCOVID-19患者数が増加傾向にある(5, 6)。 南アフリカでは、公共の場での常時のマスク着用、夜間の外出禁止、飲食店の時短営業、集会の人数制限、酒類の夜間販売停止等の対策が継続されていた(7)。
- 南アフリカハウテン州で2021年11月12 日から20日までに採取された77検体すべてがB.1.1.529系統であった(8)。他に100例以上の関連症例の存在が示唆されている(9)。11月以降に遺伝子配列が決定された新型コロナウイルスの検出割合では、B.1.1.529系統が増加傾向で、2021年11月15日時点では75％以上を占めていた（9）。
- 香港で報告された2症例のうち1例は2回のワクチン接種歴があり、10月下旬から11月にかけて南アフリカへの渡航歴があり、症状はなかった(10)。別の1例はカナダからの帰国者で2回のワクチン接種歴があり上記の症例と同じ検疫隔離用ホテルの向かいの部屋に滞在しており、発症を契機に検査を受け、陽性が判明した(11)。この２症例が滞在した２つの部屋と、同じ階の廊下と共用エリアの環境から検体が採取され、87検体中25検体が陽性であった(12)。香港衛生署衛生防護中心 (Centre for Health Protection, CHP)の発表によると、南アフリカからの帰国者症例がサージカルマスクを着用せずにホテルの部屋のドアを開けた際に、 別の1例が感染した可能性があるとしている（12)。CHPは症例が滞在した居室の左右隣3部屋に滞在していた者を隔離した。現在のところさらなる症例は報告されていない(4,12)。
- 英国は、2021年11月25日、B.1.1.529系統への懸念が高まっているとして、アフリカ南部6か国（南アフリカ、ナミビア、ジンバブエ、ボツワナ、レソト、エスティワニ）から英国への渡航者に政府指定施設隔離を義務付けると発表した(13)。同国では B.1.1.529系統をVUIとしている(13)。
国内での検出状況
- ゲノムサーベイランスでは、国内及び検疫検体にB.1.1.529系統に相当する変異を示す検体は検出されていない（2021年11月26日時点）。
- 国立感染症研究所の病原体検出マニュアルに記載のPCR検査法のプライマー部分に変異は無く、検出感度の低下はないと想定される。
評価
- B.1.1.529系統については、遺伝子配列情報から感染・伝播性や抗原性の変化を示唆されるが、ウイルスの性状に関する実験的な評価はまだない。また、疫学的な評価を行うには十分な情報がまだ得られていない。年代別の感染性への影響、重篤度、ワクチンや治療薬の効果へのフィールドでの影響、既存株感染者の再感染のリスクなどへの注視が必要である。
- 南アフリカのハウテン州を中心とした急速な感染拡大については、イベント等による人々の社会的接触機会の増大や、他の変異株の影響等の要因も排除できない。南アフリカではウイルスの遺伝子配列決定数は感染者数に対して僅かであり、また地域差もあることを考慮して解釈する必要がある。南アフリカでの感染者数の急増における本変異株の寄与の程度は明らかではないが、B.1.1.529系統が南アフリカ国内で増加している可能性がある。
- 周辺国についても、十分にゲノムサーベイランスが行われていない国もあることから、同系統の感染状況が過少評価されている可能性がある。
- B.1.1.529系統と想定されるウイルスの検疫・国内検出例はまだないが、引き続きゲノムサーベイランスで検疫・国内での監視を行う。
- 個人の基本的な感染予防策としては、変異株であっても、従来と同様に、３密の回避、特に会話時のマスクの着用、手洗いなどの徹底が推奨される。
参考文献
- Department Health Republic of South Africa. SARS-CoV-2 Sequencing & New Variant Update 25 November2021. https://sacoronavirus.co.za/2021/11/25/sars-cov-2-sequencing-new-variant-update-25-november-2021/
- World Health Organization. Tracking SARS-CoV-2 variants.
https://www.who.int/en/activities/tracking-SARS-CoV-2-variants/ - European Centre for Disease Prevention and Control. SARS-CoV-2 variants of concern as of 25 November 2021. https://www.ecdc.europa.eu/en/covid-19/variants-concern
- 香港衛生署衛生防護中心 (Centre for Health Protection, CHP.
https://www.info.gov.hk/gia/general/202111/25/P2021112500379.htm - New COVID-19 variant detected in South Africa – NICD
https://www.nicd.ac.za/new-covid-19-variant-detected-in-south-africa/ - LATEST CONFIRMED CASES OF COVID-19 IN SOUTH AFRICA (25 November 2021) - NICD
https://www.nicd.ac.za/latest-confirmed-cases-of-covid-19-in-south-africa-25-november-2021/ - Disaster management act, 2002: Amendment of regulations issued in terms of section 27 (2)
https://www.gov.za/sites/default/files/gcis_document/202110/45253rg11342gon960.pdf - Heavily mutated coronavirus variant puts scientists on Alert. Nature. 25 November 2021.
https://www.nature.com/articles/d41586-021-03552-w - Urgent briefing on latest developments around the Covid-19 vaccination programme
https://www.youtube.com/watch?v=Vh4XMueP1zQ - 香港衛生署衛生防護中心 (Centre for Health Protection, CHP). CHP investigates six additional confirmed cases of COVID-19 and follows up on compulsory quarantine arrangement concerning three imported cases involving local air crew
https://www.info.gov.hk/gia/general/202111/15/P2021111500581.htm - 香港衛生署衛生防護中心 (Centre for Health Protection, CHP). CHP investigates three additional confirmed cases of COVID-19
https://www.info.gov.hk/gia/general/202111/20/P2021112000410.htm - 香港衛生署衛生防護中心 (Centre for Health Protection, CHP). CHP provides update on latest investigations on COVID-19 imported cases 12388 and 12404
https://www.info.gov.hk/gia/general/202111/22/P2021112200897.htm - Department of Health and Social Care, UK Health Security Agency, and Department for Transport. Six African countries added to red list to protect public health as UK designates new Variant under Investigation
https://www.gov.uk/government/news/six-african-countries-added-to-red-list-to-protect-public-health-as-uk-designates-new-variant-under-investigation
注意事項
- 迅速な情報共有を目的とした資料であり、内容や見解は情勢の変化によって変わる可能性がある。
- 詳細
掲載日：2021年11月26日
第60回新型コロナウイルス感染症対策アドバイザリーボード（令和3年11月25日、厚生労働省）の報告による、我が国における新型コロナウイルス感染症の状況等についてお知らせいたします（第60回新型コロナウイルス感染症対策アドバイザリーボード 資料1）。
感染状況について
全国の新規感染者数（報告日別）は、今週先週比が0.68と減少が継続し、直近の１週間では10万人あたり約0.6と、昨年の夏以降で最も低い水準が続いている。また、新規感染者数の減少に伴い、療養者数、重症者数や死亡者数も減少が続いている。
新規感染者数の年代別割合では、60代以上が２割まで上昇する一方、10代以下が２割程度で横ばいが続いている。
- 実効再生産数：
- 全国的には、直近（11/7時点）で0.88と１を下回る水準が続き、首都圏では1.12、関西圏では0.81となっている。
- 詳細
掲載日：2021年11月18日
第59回新型コロナウイルス感染症対策アドバイザリーボード（令和3年11月17日、厚生労働省）の報告による、我が国における新型コロナウイルス感染症の状況等についてお知らせいたします（第59回新型コロナウイルス感染症対策アドバイザリーボード 資料1）。
感染状況について
全国の新規感染者数（報告日別）は、今週先週比が0.87と減少が継続し、直近の１週間では10万人あたり約１と、昨年の夏以降で最も低い水準が続いている。また、新規感染者数の減少に伴い、療養者数、重症者数や死亡者数も減少が続いている。
新規感染者数の年代別割合では、60代以上が２割弱まで上昇する一方、10代以下が２割程度で横ばいが続いている。
- 実効再生産数：
- 全国的には、直近（10/31時点）で0.84と１を下回る水準が続き、首都圏では0.96、関西圏では0.80となっている。
- 詳細
国立感染症研究所
（掲載日：2021年11月15日）
2021年11月7日現在、国内ではファイザー製、武田/モデルナ製、アストラゼネカ製の新型コロナワクチン（ 以下、ワクチン ）が使用されています。ファイザー製と武田/モデルナ製の接種対象は12歳以上で、アストラゼネカ製の接種対象は原則40歳以上です。米国では11月2日に開催された予防接種の実施に関する諮問委員会（Advisory Committee on Immunization Practices：ACIP）で、5～11歳の小児に対するファイザー社製ワクチンの接種推奨が決まりましたが（1）、国内ではまだ12歳未満の小児に接種可能なワクチンはありません。
11月5日現在の国内での総接種回数は1億9,104万4,946回で、このうち高齢者（ 65歳以上 ）は6,525万152回、職域接種は1,907万8,083回でした。11月5日時点の1回以上接種率は全人口（1億2,664万5,025人）の77.8％、2回接種完了率は73.1％で、高齢者の1回以上接種率は、65歳以上人口（3,548万6,339 人）の91.6％、2回接種完了率は90.8％でした。11月1日公表時点の年代別接種回数別接種者数と接種率/完了率（ 図1 ）を示します。また、新規感染者数と累積接種割合についてまとめました（ 図2 ）。
注）接種率は、VRSへ報告された、一般接種（高齢者を含む）と先行接種対象者（接種券付き予診票で接種を行った優先接種者）の合計回数が使用されており、使用回数には、首相官邸HPで公表している総接種回数のうち、職域接種及び先行接種対象者のVRS未入力分である約1000万回分程度が含まれておらず、年齢が不明なものは計上されていません。また、年齢階級別人口は、総務省が公表している「令和3年住民基本台帳年齢階級別人口（市区町村別）」のうち、各市区町村の性別及び年代階級の数字を集計したものが利用されており、その際、12歳～14歳人口は10歳～14歳人口を5分の3したものが使用されています。
図2 日本＿新規感染者数と累積接種割合の推移 ［データ範囲：2020年1月22日～2021年10月29日］下記データより作図.Roser M, Ritchie H, Ortiz-Ospina E and Hasell J. (2020) - "Coronavirus Pandemic (COVID-19)". Published online at OurWorldInData.org. Retrieved from: 'https://ourworldindata.org/coronavirus' [Online Resource]（閲覧日2021年11月3日）
参考文献
- 米国Advisory Committee on Immunization Practices(ACIP): https://www.cdc.gov/vaccines/acip/index.html（閲覧日2021年11月7日）
今回は、下記の内容について、最近のトピックスをまとめました。
【本項の内容】
- 海外のワクチン接種の進捗と感染状況の推移・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・3
- ワクチン接種後の免疫力の低下について・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・9
- 懸念される変異株（VOCs）に対するワクチン有効性について・・・・・・・・・・・・・10
- ワクチン接種後発症の心筋炎関連事象について・・・・・・・・・・・・・・・・・・・14
- 様々なモダリティのワクチンについて～組換えタンパクワクチン・・・・・・・・・・・17
- 詳細
掲載日：2021年11月10日
第58回新型コロナウイルス感染症対策アドバイザリーボード（令和3年11月9日、厚生労働省）の報告による、我が国における新型コロナウイルス感染症の状況等についてお知らせいたします（第58回新型コロナウイルス感染症対策アドバイザリーボード 資料1）。
感染状況について
全国の新規感染者数（報告日別）は、今週先週比が0.76と減少が継続し、直近の１週間では10万人あたり約１と、昨年の夏以降で最も低い水準が続いている。また、新規感染者数の減少に伴い、療養者数、重症者数や死亡者数も減少が続き、重症者数は昨年の秋以降で最も低い水準になるとともに、死亡者数は今回の感染拡大前の水準を下回った。
- 実効再生産数：
- 全国的には、直近（10/24時点）で0.81と１を下回る水準が続き、首都圏では0.72、関西圏では0.89となっている。
（注）死亡者数は、各自治体が公表している数を集計したもの。公表日ベース。
- 詳細
2021年11月9日
端緒
新型コロナウイルス感染症のワクチン開発は未曾有のスピードで進み、ファイザー社製およびモデルナ社製のmRNAワクチンは大規模なランダム化比較試験で有効性（vaccine efficacy）が90％以上とされ、アストラゼネカ社製のウイルスベクターワクチン1種類も有効性が70％程度とされた1-3。国内外で緊急使用許可や製造販売承認を受け、実社会におけるワクチン導入初期の有効性（vaccine effectiveness）も海外で評価されており、ランダム化比較試験と同等の有効性を認めた4-5。国内においても、国立感染症研究所にて、複数の医療機関の協力のもとで、発熱外来等で新型コロナウイルスの検査を受ける者を対象として、症例対照研究（test-negative design）6を実施しており、この暫定報告の第一報では、国内においても高い有効性が示された7。しかし、前回報告では、B.1.1.7系統（アルファ株）からB.1.617.2系統（デルタ株）の置き換わり期であったため8、デルタ株に対する有効性については更なる検討が必要であった。そこで、今回は、関東において月初めにはデルタ株が9割以上を占め、月末にはほぼ全ての検出株がデルタ株であった8月の調査における暫定結果を報告する。
- 詳細
■国際感染症分野のキャリアアップセミナー
感染症に立ち向かうグローバルヘルス人材の拡大〜
- 日時：2021年11月12日（金）17:30-19:00
- 開催方法：Zoomウェビナーによるオンラインセミナー
- 受講料：無料
- 申込み方法：ウェビナー登録
- 主催：国立国際医療研究センター グローバルヘルス人材戦略センター
国立感染症研究所 感染症危機管理研究センター - プログラム：
17：30-17：40
開会とグローバルヘルスのランドスケープ
グローバルヘルス人材戦略センター長/WHO執行理事 中谷 比呂樹
17：40-18：00
健康危機管理人材と当面のジョブ・オポチュニティ
国立感染症研究所感染症危機管理研究センター長 齋藤 智也
18：00-18：50
パネルディスカッション
座長：齋藤 智也
国立国際医療研究センター国際感染症センター長 大曲 貴夫
国立感染症研究所感染症疫学センター長 鈴木 基
国立感染症研究所実地疫学研究センター長 砂川 富正
厚生労働省健康局結核感染症課 杉原 淳
厚生労働省東京空港検疫所支所 髙橋 里枝子 - 18：50-19：00
まとめ 中谷 比呂樹
詳細および申込み方法は「リーフレット」をご覧いただきますようお願い申し上げます。
- 詳細
掲載日：2021年10月30日
第57回新型コロナウイルス感染症対策アドバイザリーボード（令和3年10月26日、厚生労働省）の報告による、我が国における新型コロナウイルス感染症の状況等についてお知らせいたします（第57回新型コロナウイルス感染症対策アドバイザリーボード 資料1）。
感染状況について
全国の新規感染者数（報告日別）は、今週先週比が0.57と減少が継続し、直近の１週間では10万人あたり約２となっており、昨 年の夏以降で最も低い水準となった。一方、60代以上及び10代以下の新規感染者も減少が続いているが、感染者に占める割合 は、60代以上は８月を底として２割弱まで上昇しており、10代以下は９月以降、２割程度で横ばいの状態が続いている。
新規感染者数の減少に伴い、療養者数、重症者数や死亡者数も減少が続いており、重症者数は今回及び今春の感染拡大前 の水準以下となった。一方、死亡者数は今回の感染拡大前の水準を超えている。
緊急事態措置等の解除後、多くの地域で夜間滞留人口の増加が継続しており、新規感染者数の今後の動向に注意が必要。
- 実効再生産数：
- 全国的には、直近（10/9時点）で0.70と１を下回る水準が続き、首都圏では0.60、関西圏では0.68となっている。
（注）死亡者数は、各自治体が公表している数を集計したもの。公表日ベース。
- 詳細
国立感染症研究所
2021年10月28日12:00時点
変異株に関する新たな分類の導入について
変異株の分類についてはWHOの暫定定義を準用し、国内の流行状況を加味して「懸念される変異株（VOC）」と「注目すべき変異株（VOI）」に分類してきた。WHOでは9月より新たに、「監視下の変異株（VUM: Variants Under Monitoring）」の分類を設け、ウイルスの特性に影響を与えると思われる遺伝子変異を持つものの、表現型や疫学的な影響の証拠は現時点では不明である変異株を分類している。また、VOC/VOIにかつて分類されていたが、その後検出されなくなった、或いは公衆衛生的意義が薄れた変異株についてVUMとして一定期間監視を行うとしている。今般、国内外の変異株の疫学的状況が変化しつつあり、また、監視体制を強化し、早期の対応につなげる観点から、「監視下の変異株（VUM）」の分類を国立感染症研究所でも設定する（表１、表３）。
表1 国立感染症研究所による国内における変異株の分類（2021年10月28日時点）
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分類 |
定義 |
主な対応 |
該当 変異株 |
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懸念される変異株 (VOC; Variants of Concern) |
公衆衛生への影響が大きい感染・伝播性、毒力*、及び治療・ワクチン効果の変化が明らかになった変異株 |
対応 週単位で検出数を公表（IDWR) ゲノムサーベイランス（国内・検疫） 必要に応じて変異株PCR検査で監視 積極的疫学調査 |
ベータ株 ガンマ株 デルタ株 |
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注目すべき変異株 (VOI; Variants of Interest) |
公衆衛生への影響が見込まれる感染・伝播性、毒力、及び治療・ワクチン効果や診断に影響がある可能性がある、又は確実な変異株で、国内侵入・増加の兆候やリスクを認めるもの（以下、例） ・検疫での一定数の検知 ・渡航例等と無関係な国内での検出 ・国内でのクラスター連鎖 ・日本との往来が多い国での急速な増加 |
警戒 週単位で検出数を公表（IDWR) ゲノムサーベイランス（国内・検疫）で監視 積極的疫学調査 必要に応じて変異株PCR検査の準備
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該当なし |
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監視下の変異株 (VUM; Variants Under Monitoring) |
公衆衛生への影響が見込まれる感染・伝播性、毒力、及び診断・治療・ワクチン効果に影響がある可能性がある変異を有する変異株 また、VOCやVOIに分類された変異株であっても、以下のような状況では、本分類に一定期間位置付ける ・世界的に検出数が著しく減少 ・追加的な疫学的な影響なし ・国内・検疫等での検出が継続的に僅か ・特に懸念される形質変化なし |
監視 発生状況や基本的性状の情報収集 ゲノムサーベイランス（国内・検疫）で監視 (VOC/VOIからVUMに移行後国内発生が継続するものは）週単位で検出数を公表 (IDWR)
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アルファ株 （旧）カッパ株 ラムダ株 ミュー株 AY.4.2
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* 毒力virulence: 病原体が引き起こす感染症の重症度の強さ
IDWR: 感染症発生動向調査週報
変異株の再分類
- これまでVOCに指定されていた変異株の中では、B.1.1.7系統の変異株（アルファ株）は、検出数が世界的に継続して減少しており、国内でも9月上旬以降、国際ゲノムデータベースであるGISAID（Global Initiative on Sharing All Influenza Data, https://www.gisaid.org）への登録がない。感染・伝播性は現在流行の中心であるデルタ株より低く、抗原性への影響がみられない。WHOと英国健康安全保障庁（HSA）はVOCの分類を維持しているが、欧州CDC、米国CDCは、それぞれ警戒解除した変異株(De-escalated variant)、監視中の変異株（VBM：Variant being monitored）に分類を変更している。以上の状況を鑑みて、我が国における分類をVUMに変更する。
- B.1.351系統の変異株（ベータ株）、P.１系統の変異株（ガンマ株）については、世界的に検出数は継続して減少しているものの、一部の地域で発生が継続しており、抗原性の変化への影響を考慮して引き続きVOCに分類する。なお、米国CDCは共にVBMに分類している。
- B.1.617.２系統の変異株（デルタ株）は、世界で検出されるウイルスの99%以上を占めており、国内でもほぼ100％置き換わっている。しかし、ワクチンの一部の効果の減弱が指摘されていること、また追加の変異やその亜型（AY.x系統）の動向が必要とされていることから、引き続きVOCに分類する。
- VOIに位置付けてきたB.1.617.1系統の変異株（旧カッパ株）は、インドで4月に増加が見られたが、現在は終息している。国内では8例、検疫で19例が検出されているが、最終検出日は国内では2021年5月7日、検疫では 2021年5月1日である。国外からの流入が複数回あったことが確認できるが、国内では終息していると考えられる。WHOはVUMに分類を変更し「カッパ株」の呼称は取りやめ、欧州CDC、英国HSA、米国CDCがそれぞれ警戒解除した変異株(De-escalated variant)、調査中の変異株（VUI：Variant under investigation）、VBMに分類を変更している。世界的にも報告が著しく減少していることから、我が国における分類をVUMに変更する。
E484Qを含むデルタ株の事例について
- デルタ株の中で、これまでVOC/VOIに見られたスパイクタンパクの特徴的な変異が加わった変異株について注視する動きがある。欧州CDCはデルタ株への追加変異として、スパイクタンパクにK417N、E484Q、Q613Hの各アミノ酸置換（以下便宜的に「変異」という。）が加わったものをVUMとして監視対象としている。
- これらの追加変異の入ったウイルスの検出事例は検疫・国内で散見しているが、E484Qを含むデルタ株については、10月に入ってからも国内でいくつか検出がある。国内感染が示唆されるが、共に感染源不明の事例であり、国内で複数のE484Qを含むデルタ株が一定数存在する可能性がある。E484Q変異は感染・伝播性の増加や中和抗体の感受性が低下する可能性があるが、現在のところ国内で公衆衛生的に追加的な影響があることを示唆する所見はない。
- VOCに位置付けるデルタ株の一部として、ゲノムサーベイランスや分子疫学調査で、顕著な疫学的変化（ブレークスルー感染、巨大クラスター化、二次感染率の増加、顕著な検出率の増加等）と関連するか引き続き注意する。
新たにVUMに位置付けられた変異株について
これまでVOCs/VOIsに位置付けていなかった変異株の中では、新たにC.37系統の変異株（ラムダ株）、B.1.621系統 (ミュー株)、AY.4.2系統の各変異株をVUMに分類する。
C.37系統の変異株 （ラムダ株）について
- ラムダ株は、ペルーで2020年8月に初めて報告された。ラムダ株のスパイクタンパクの特徴的な変異としては、L452Q, F490S, D614G変異があり、感染・伝播性の増加と中和抗体への抵抗性と関連している可能性がある（1,2）。
- ラムダ株は、第13報でも報告していたが、主に南米地域で比較的多くの割合を占めていたが、いずれの国においても減少傾向にある。
- 検疫ではこれまで4例認めており、2021年9月6日の例が最後である。国内での検出流はない。
- WHO、欧州CDCは引き続きVOIに位置付けているが、英国はVUIから“Monitoring（監視対象）”に位置付けを変更している。
- 国立感染症研究所では、現状、ラムダ株が国内で拡大するリスクは非常に低いと考えるが、流行地域における動向を把握する必要性からVUMとして監視対象に位置付ける。
B.1.621系統の変異株 （ミュー株）について
- ミュー株は、コロンビアで2021年1月に初めて検出された。ＷＨＯのVOCが有するE484K, N501Y, P681H等の変異を有することから、感染・伝播性の増加や抗原性の変化が懸念されている。また、既存株の回復期血清やワクチン接種後の血清に対し中和抗体価が低下していることを示す実験的な報告もある（3,4）。
- 地域的には、コロンビアとチリで検出数が多い。GISAIDの登録情報によれば、世界的には5月から検出割合が増加したが8月から減少傾向にある。
- 検疫では、2例（最終検出日：2021年7月5日）が検出されているが、国内での検出は無い。
- ミュー株について、WHO、欧州CDCはVOIに位置付け、英国HSA、米国CDCはそれぞれVUI、VBMに位置付けている。
- 国立感染症研究所としては、ミュー株が国内で拡大するリスクは現状において低いと考えるが、流行地域における動向を把握する必要性からVUMとして監視対象に位置付ける。
AY.4.2系統の変異株 について
- デルタ株は、PANGO系統のB.1.617.2系統及びその亜系統にあたるAY系統を含んでいるが、AY系統の中のAY.4.2系統が英国で増加している。
- AY.4.2系統は、AY.4系統（B.1.617.2.4系統に相当）の亜系統として、PANGO系統分類の系統判別プログラム定義ファイルの更新（2021年10月4日、ｖ.1.2.8）により新たに定義がなされた。
- AY.4.2系統は、デルタ株やAY.4系統の変異に加え、スパイクタンパクにY145H、A222Vの各変異が入っていることが特徴とされる。これらの変異箇所は、スパイクタンパクのN末端側の変異であり、抗体医薬やワクチンにより誘導される抗体が標的とするエピトープ領域とは異なるため、免疫逃避などの影響は少ないと考えられるが、感染・伝播性や抗原性への影響に関して、疫学的・ウイルス学的な性質の評価に関する情報は現時点では十分に得られていない。
- GISAID上、AY.4.2系統は25,222件登録されており、その93.8％は英国からの登録であったが、日本の検疫を含む多くの地域からも検出されている。（10月25日時点）
- 英国は10月15日にAY.4.2系統を"Monitoring（監視対象）"に位置づけ（5)、10月20日にVUI（調査中の変異株）に位置づけた(6)。英国内では、デルタ株が約99.8％を占めており、そのデルタ株の中でもAY.4系統の割合が多かったが、さらにそのサブ系統であるAY.4.2系統の変異株が、当地で流行するその他の変異株に比較して速く増加しており、9月27日の週で英国で解析された検体の6％程度に検出されていることを指摘していた（5)。英国健康安全保障庁は、AY.4.2の増加率は、各地域で流行しているAY.4.2以外と比べて17%高い*と試算している（*この増加率は本系統の生物学的な感染・伝播性の増加の可能性だけでは無く、流行地の疫学的状況等にも左右されるものであり、解釈に注意を要する）。英国では、英国外の多数の国からの旅行者からも本系統が検出されており、その発生時期や起源は不明としている（6）。また、家庭における２次感染率が、AY.4.2系統で12.4% (95%CI: 11.9%-13.0%)とその他のデルタ株（11.1% (95%CI: 11.0%-11.2%)）に比べて有意に高かった。家庭以外でもAY.4.2で２次感染率が高かったがその差は有意ではなかった。地域ごとの２次感染率の差異は観察されていない（6)。
- 欧州CDCは10月21日にVUMに位置付けた。なお、欧州CDCは域内での「検出」という位置づけであり、コミュニティでの流行とは判断していない(7)。
- 我が国では、検疫で2021年8月28日に英国滞在歴のある入国者から検出されたデルタ株の1例について、これまでのPANGO系統判定プログラムではAY.4系統と判定されていたが、AY.4.2系統を含む定義ファイルに更新された系統判定プログラムでは、AY.4.2系統と判定された。なお、ウイルス分離を試みたがウイルスを分離することはできなかった。なお、10月28日時点で、国内ではAY.4.2系統と判定されたウイルスの検出はない。
- 国立感染症研究所では、本系統は感染性が高まっている可能性を踏まえ、VUMに位置付け、諸外国の情報収集を継続するほか、ゲノムサーベイランスで国内の状況を監視する。
引用文献 （1－4 は査読前のプレプリント論文である）
- Acevedo ML, et al. Infectivity and immune escape of the new SARS-CoV-2 variant of interest Lambda. medRxiv. 2021.
- Tada T, et al. SARS-CoV-2 Lambda Variant Remains Susceptible to Neutralization by mRNA Vaccine-elicited Antibodies and Convalescent Serum. bioRxiv. 2021.
- Uriu K, et al. Ineffective neutralization of the SARS-CoV-2 Mu variant by convalescent and vaccine sera. bioRxiv 2021.09.06.459005; doi: https://doi.org/10.1101/2021.09.06.459005.
- Miyakawa, K., et al. Neutralizing efficacy of vaccines against the SARS-CoV-2 Mu variant. medRxiv 2021.09.23.21264014; doi: https://doi.org/10.1101/2021.09.23.21264014.
- UK Health Security Agency. SARS-CoV-2 variants of concern and variants under investigation in England: Technical briefing 25. 15 October 2021.
- UK Health Security Agency. SARS-CoV-2 variants of concern and variants under investigation in England: Technical briefing 26. 22 October 2021.
- European Centre for Disease Prevention and Control. SARS-CoV-2 variants of concern as of 21 October 2021: https://www.ecdc.europa.eu/en/covid-19/variants-concern.
注意事項
迅速な情報共有を目的とした資料であり、内容や見解は情勢の変化によって変わる可能性がある。
更新履歴
第14報 2021/10/28 12:00時点
第13報 2021/08/28 12:00 時点
第12報 2021/07/31 12:00 時点
第11報 2021/07/17 12:00 時点
第10報 2021/07/06 18:00時点
第 ９報 2021/06/11 10:00時点
第 ８報 2021/04/07 17:00 時点
第 ７報 2021/03/03 14:00時点
第 ６報 2021/02/12 18:00時点
第 ５報 2021/01/25 18:00時点 注）タイトル変更
「感染・伝播性の増加や抗原性の変化が懸念されるSARS-CoV-2の新規変異株について」
第 ４報 2021/01/02 15:00時点
第 ３報 2020/12/28 14:00時点
第 ２報 2020/12/25 20:00時点 注）第１報からタイトル変更
「感染性の増加が懸念されるSARS-CoV-2新規変異株について」
第 １報 2020/12/22 16:00時点 「英国における新規変異株（VUI-202012/01）の検出について」
- 詳細
一般的にウイルスは増殖や感染を繰り返す中で徐々に変異をしてくことが知られており、新型コロナウイルスについても少しずつ変異をしています。大半の変異はウイルスの特性にほとんど影響を及ぼしませんが、一部の変異では、感染・伝播性、重症化リスク、ワクチン・治療薬の効果、診断法などに影響を及ぼすことがあります。 国立感染症研究所では新型コロナウイルスの変異株について迅速リスク評価を行い、「懸念される変異株（VOC）」、「注目すべき変異株（VOI）」、「監視下の変異株（VUM）」に分類しています。
国立感染症研究所による国内における変異株の分類（2023年4月21日時点）
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分類 |
定義 |
主な対応 |
該当 変異株 |
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懸念される変異株 (VOC; Variants of Concern) |
公衆衛生への影響が大きい感染・伝播性、毒力*、及び治療・ワクチン効果の変化が明らかになった変異株 |
対応 週単位で検出数を公表 ゲノムサーベイランス（国内・検疫） 必要に応じて変異株PCR検査で監視 積極的疫学調査 |
オミクロン※ |
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注目すべき変異株 (VOI; Variants of Interest) |
公衆衛生への影響が見込まれる感染・伝播性、毒力、及び治療・ワクチン効果や診断に影響がある可能性がある、又は確実な変異株で、国内侵入・増加の兆候やリスクを認めるもの（以下、例） ・検疫での一定数の検知 ・渡航例等と無関係な国内での検出 ・国内でのクラスター連鎖 ・日本との往来が多い国での急速な増加 |
警戒 週単位で検出数を公表 ゲノムサーベイランス（国内・検疫）で監視 積極的疫学調査 必要に応じて変異株PCR検査の準備
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該当なし |
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監視下の変異株 (VUM; Variants Under Monitoring) |
公衆衛生への影響が見込まれる感染・伝播性、毒力、及び診断・治療・ワクチン効果に影響がある可能性がある変異を有する変異株 また、VOCやVOIに分類された変異株であっても、以下のような状況では、本分類に一定期間位置付ける ・世界的に検出数が著しく減少 ・追加的な疫学的な影響なし ・国内・検疫等での検出が継続的に僅か ・特に懸念される形質変化なし |
監視 発生状況や基本的性状の情報収集 ゲノムサーベイランス（国内・検疫）で監視 週単位で検出数を公表
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該当なし |
* 毒力virulence: 病原体が引き起こす感染症の重症度の強さ
※ VariantのPango系統やNextstrainクレードといった分類が複雑で覚えにくく、初めて報告された地名などが呼称として使用されていることが、差別や偏見につながることも懸念して、2021年5月より、WHOは代表的なvariantに対してギリシャ文字の呼称を定めている。これまで”variant”の訳語として「変異株」、WHOが呼称を定めたvariantについてそれを用いて「〇〇株」と称してきた(例：B.1.1.7系統＝アルファ株、B.1.1.529系統＝オミクロン株)。しかし、B.1.1.529系統が主流となって以降、亜系統が広く分岐し、さらにWHOが用いる呼称で総称される系統・亜系統の抗原性等の性質が多様化しており、遺伝的に同一、又はほぼ均一なウイルスの集合体を示す「株」を、WHOが用いる呼称に対応して用いることが適さなくなってきている。そのため、WHOが呼称を定めた各variantについて「アルファ」「オミクロン」のように表現することとした。
なお、「〇〇株」は一般に広く使用されている用語となっており、通称として引き続き用いることを妨げるものではない。
● 国立感染症研究所が公表している新規変異株に関する報告
● 変異株に関する疫学調査
● 国立感染症研究所のゲノム解析の実施状況及びPANGO系統別検出状況